Diagnostic du sarcome en une seule réaction

Le test SarcomaFusion détecte les transcrits de fusion dans les sarcomes. Ces transcrits, associés à des sous-types spécifiques et à des traitements ciblés, sont cruciaux pour les soins aux patients. Utilisant la technologie brevetée de PCR ligation-dépendante, le test simplifie les diagnostics et améliore notre compréhension de la biologie des sarcomes. Son protocole rapide et sa robustesse en font un outil précieux en oncologie.

 

 

 

Les transcrits de fusion sont fréquemment observés dans environ 1/3 des tumeurs des tissus mous, et la littérature scientifique décrit plus de 140 fusions différentes.

Ces fusions sont souvent associées à des sous-types histologiques spécifiques ainsi qu'à des traitements ciblés, en faisant ainsi des marqueurs diagnostiques moléculaires extrêmement utiles.

La détection précise de ces transcrits de fusion revêt une importance capitale pour la prise en charge optimale des patients atteints de sarcomes.

Dans ce contexte, le test SarcomaFusion, développé par Genexpath, offre une solution économique et efficace pour la détection des transcrits de fusion responsables de ces sarcomes. Grâce à cette approche, les transcrits de fusion spécifiques aux sarcomes peuvent être détectés et évalués en une seule analyse complète, simplifiant ainsi le processus diagnostique et permettant une meilleure compréhension de la nature moléculaire des tumeurs sarcomateuses.

 

 

 

 

 

Le test GENEXPATH SarcomaFusion repose sur une méthode de RT-PCR dépendante de ligation (LD-RTPCR). Cette technique semi-quantitative permet d’évaluer simultanément les niveaux d’expression d’un grand nombre de marqueurs génétiques et plus précisément pour ce test, des translocations chromosomiques à l’aide de couples de sondes oligo-nucléotidiques spécifiques de chacun de ces marqueurs.

 

Un protocole simple et rapide 

A partir d’un extrait d’ARN total, quatre étapes sont suffisantes pour obtenir les librairies. Une étape de transcription inverse. Une étape d’hybridation des sondes oligonucléotidiques. Une étape de ligation. Une étape d’amplification par PCR Puis séquençage des librairies. Pas de purification préalable nécessaire, limitant les pertes de matériel et assurant une sensibilité élevée. Sondes ciblant de courtes séquences génétiques (40-60 bases), offrant une robustesse face à la dégradation des ARN. Adapté aux échantillons difficiles tels que les biopsies tissulaires fixées en paraffine. Seulement environ 105 séquences requises par échantillon pour obtenir un profil d'expression analysable. Possibilité de charger les librairies GENEXPATH SarcomaFusion avec d'autres librairies de séquençage pour optimiser les coûts.