ONCOTARGET : Panel de profilage génomique complet pour la détection du cancer

ONCOTARGET : Panel de profilage génomique complet pour la détection du cancer

ONCOTARGET est un panel de profilage génomique complet conçu pour la détection du cancer. Il se compose de 1 229 sondes ciblant 10 oncogènes et le gène TP53. Les cliniciens peuvent utiliser ce kit pour guider les décisions thérapeutiques sur la base des résultats de génotypage obtenus à partir de différents types d'échantillons, y compris les tumeurs fraîches ou congelées, les tissus FFPE et les échantillons liquides. Le rapport coût-efficacité et la précision du panel en font un outil précieux pour la recherche en oncologie et les soins aux patients.

Le panel de profilage génomique ONCOTARGET

Le Panel ONCOTARGET est une combinaison de 1229 sondes différentes, réparties sur l’ensemble des séquences codantes de 10 Oncogènes d’intérêt, reliés à une autorisation de mise sur le marché d’une Oncothérapie, ainsi que du gène TP53 (voir tableau). 

Le kit ONCOTARGET a été développé pour apporter une réponse rapide et fiable à partir de tout type de prélèvements d’origine humaine dans le but d’aider le praticien à orienter le traitement d’un patients atteints de cancer. Il est utilisable sur l’ADN extrait de tumeurs fraîches ou congelées, fixées et incluses en paraffine (FFPE)  ainsi que sur de l’ADN provenant d’échantillons liquides (prélèvements plasmatiques, liquides pleuraux, liquides céphalorachidiens). Il est également utilisable sur l’ADN extrait de lignées cellulaires humaines. Sa taille restreinte et la faible profondeur de séquençage nécessaire (> 80X) permet des analyses à faible coût.

Le panel ONCOTARGET peut être utilisé pour détecter les mutations présentes sur l’ensemble des parties codantes de 10 gènes qui sont utilisées pour orienter la thérapie de 1ère ou 2ème ligne métastatique de plusieurs cancers solides, ainsi que du gène TP53. 

Pour cela, le panel ONCOTARGET analyse la totalité de la séquence codante (exons codants + splicing zones) de 11 gènes d’intérêt (ALK, BRAF, EGFR, ERBB2 (HER2), KIT, KRAS, MAP2K1, MET, NRAS, PDGFRA, TP53) pour l’étude des tumeurs solides du poumon (non à petites cellules), les tumeurs colorectales, les mélanomes et les tumeurs stromales gastrointestinales (GIST). Il permet également de détecter les mutations introniques éloignées autour de l’exon 14 de MET qui impliquent une activation constitutive de MET. (voit tableau)

 

Tableau: Détails des gènes analysés

 

Gène

Type de Tumeur

Traitement associé Impact
ALK Cancer du Poumon Non à petites cellules ALK TKI Sensibilité de la résistance à l'inhibiteur de l'ALK.
BRAF Cancer du côlon Non thérapeutiques Test MSI
Cancer du Poumon Non à petites cellules BRAF inhibiteur Sensibilité uniquement pour le variant p.(Val600Glu).
Mélanome BRAF inhibiteur Sensibilité uniquement pour les variants p.(Val600X)
EGFR Cancer du Poumon Non à petites cellules EGFR TKI Sensibilité ou résistance (mutations secondaires, insertions exon 20)
ERBB2 Cancer du Poumon Non à petites cellules Mobocertinib Sensibilité
KIT GIST Imatinib Sensibilité ou résistance (mutations secondaires)
Mélanome Imatinib Sensibilité
KRAS Cancer du côlon EGFR inhibiteur Résistance
Cancer du Poumon Non à petites cellules Sotorasib Sensibilité uniquement pour le variant p.(Gly12Cys).
MAP2K1 Mélanome BRAF inhibiteur Résistance
  MEK inhibiteur Sensibilité ou résistance
MET Cancer du Poumon Non à petites cellules MET TKI Sensibilité
NRAS Cancer du côlon EGFR inhibiteur Résistance
Mélanome Pronostic /
PDGFRA GIST Imatinib Sensibilité ou résistance (mutations secondaires)

GIST: tumeur stromale gastro-intestinale ; MSI: instabilité des microsatellites ; TKI: inhibiteur(s) de la tyrosine kinase.

Fichiers bioinformatiques pour l'analyse d'Oncotarget : Merci de contacter tech@hexabiogen.com

Nos Produits:

 

Cat# Description Cond.

NB-62-0001-8

ONCOTARGET NGS Kit 8rxns

NB-62-0001-16

16rxns

NB-62-0001-32

32rxns

NB-62-0001-96

96rxns

NB-62-0001-384

384rxns

 

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