Les pièges LC3

Les pièges LC3

Les pièges LC3 ont été développés pour isoler les protéines LC3/GABARAP endogènes des cellules de mammifères. Les pièges à LC3 ont été modifiés pour contenir des régions multimériques interagissant avec LC3 (LIR) afin d'augmenter leur affinité pour les protéines LC3/GABARAP dans diverses lignées cellulaires. Les pièges à LC3 F sont basés sur 8 séquences LIR consensuelles avec des acides aminés hydrophobes prédominants F typiquement trouvés dans le récepteur de l'autophagie OPTN. Ces LIR sont connus pour leur affinité et leur spécificité vis-à-vis d'un ou de plusieurs membres de la famille LC3/GABARAP. Les pièges F de LC3 se lient de préférence aux protéines GABARAP, GABARAP-L1 et GABARAP-L2 dans les cellules de mammifères, et à LGG1 dans le modèle de C. elegans. L'affinité des pièges LC3 a été mesurée à l'aide de la thermophorèse à micro-échelle (MST) et estimée dans la gamme des nanomol

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