Les milieux de transport pour les micro-organismes sont essentiellement des solutions de tampons contenant des glucides, des peptones et d'autres nutriments (à l'exclusion des facteurs de croissance) conçus pour préserver la viabilité des bactéries pendant le transport sans permettre leur multiplication. L'objectif principal de l'utilisation du milieu de transport est de maintenir l’échantillon dans un état aussi proche que possible de son état d'origine.

Le milieu de transport viral (ou VTM pour Viral Transport Medium) permet le transfert en toute sécurité des virus, des chlamydiae et des mycoplasmes pour de nouvelles recherches, y compris des méthodes classiques de culture cellulaire, des tests de diagnostic, ainsi que des techniques de biologie moléculaire. Les milieux de transport viraux préparés commercialement sont disponibles dans un tube en plastique à bouchon vissé qui contient des protéines tamponnées (sérum, albumines ou gélatine) et des antibiotiques. Les antibiotiques sont généralement incorporés dans les milieux de transport viraux pour supprimer la croissance des bactéries et des champignons contaminants, de sorte que des échantillons séparés du même site doivent être collectés si des cultures bactériennes ou fongiques sont également demandées.