Séquençage de l'ARN messager (ARNm) total par NGS - Préparation de banques

Le séquençage de l'ARNm (mRNA-Seq), également appelé séquençage aléatoire du transcriptome entier (whole transcriptome shotgun sequencing), est devenu la méthode de choix pour analyser le transcriptome dans différentes situations comme des états pathologiques ou des processus biologiques. Le séquençage de l’ARNm est un moyen très sensible et précis pour quantifier l'expression des gènes.  De plus, cela permet d’identifier des isoformes de transcripts connues et nouveaux, des fusions de gènes ainsi que l'expression spécifique d'allèles. Le séqeunçage de l’ARN messager fournit une vue complète du transcriptome codant qui n'est pas limitée par le filtre des connaissances préalables.

La méthode la plus courante est celle visant les ARN polyadénylés car ceux-ci représentent les ARNm stables et donc non ciblés pour dégradation, qui correspondent donc principalement à des ARNm dont le but est la traduction en protéine. De plus, la sélection des ARN polyadénylés permet l'élimination des ARN ribosomaux qui ne sont pas sujets à ce phénomène.